Ая весной

большинство специалистов полагает, что впадина озера Ая имеет кавитационно-эворзионное происхождение. Эти впадины являются эворзионными котлами высверливания, выбитыми энергичными водопадами при прохождении дилювиальных потоков по магистральной долине стока — Катуни — из катастрофически прорывавшихся гигантских ледниково-подпрудных озёр в верховьях рр. Катуни и Чуи
Впадина озера Ая, как и другие подобные ей котловины, является характерным элементом Алтайского скэбленда. На глубине 15 м находится слой с повышенным содержанием сероводорода.